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潛艦國造召集人、前參謀總長黃曙光9月28日前受訪談到前降相關政策時，透露有一名立委「一直在搞」，但並未點出姓名，馬文君委員當日公開聲明，如果黃曙光指明是她，她一定提告。
前海軍顧問郭璽，9月29日時明確點出這個「一直在搞」的立委就是馬文君，並指控馬涉嫌將潛艦國造及相關採購資料帶出會議，甚至提供給中國。馬文君隔日在律師陪同下，按鈴控告郭璽加重誹謗，反控郭璽才是遊走中國大陸、仲介買賣，手段邪派的軍火掮客，對她進行抹黑。郭璽也於昨日到台北地檢署按鈴控告馬文君委員。
針對郭璽的指控，法務部長蔡清祥今天表示，高檢署已經證實分案調查，同時對於馬文君委員稱1月時送了一個音檔到國防部跟檢調單位，內容是關於郭璽介入潛艦國造，但後來沒有下文的外界質疑表示會再了解。